在朝廷没有任命新的湖广总兵的情况之下，太子朱厚照让湖广巡抚阎仲宇全权负责此次湖广卫所的整顿。
湖广巡抚阎仲宇自然明白太子朱厚照的意思。
此次李再万事件，虽然最后取得了胜利，但湖广军队的表现，也是令湖广巡抚阎仲宇感到有些羞愧。
要不是太子率领的两个火器卫所，湖广的脸面那可是丢大发了。
因此，他尽心尽力来做此事。
对于在武昌集结的武昌卫、长沙卫、宝庆卫、荆州卫和勋阳卫，太子朱厚照交给了王守仁来负责。
其实，在太子朱厚照决定将武昌卫、长沙卫、宝庆卫、荆州卫和勋阳卫集结到武昌进行统一集训时，有很多人都主动找到太子，希望能够让其来做这件事情。
可是太子朱厚照并没有答应。而是将其交给了王守仁。
可以说，太子朱厚照在决定将五个卫调到武昌的想法时，第一个想到的人选，就是王守仁。
至于武昌卫和长沙卫改为火器卫所。太子朱厚照特意安排蒋善和包长善全权负责。一个人负责一个卫的改造。另外，顺道将补充兵员的羽林前卫和虎贲左卫一并进行训练。
此次平叛，羽林前卫和虎贲左卫可以说是立下了汗马功劳。一个硬骨头接着一个硬骨头。
虽然取得了最后的胜利，可是两个卫的损失也是非常巨大的。都超过了一半。
太子朱厚照没有明说，可是他的内心是非常不好受的。这两个卫从决定改造为火器卫所那一刻起，太子朱厚照就倾注了大量的心血。
这两个卫一直作为太子的嫡系，跟随太子奔走于江南诸省。为江南的改革作出了巨大的贡献。
至于平叛，更是冲在了最前面。
蒋善和包长善从两个卫所里挑选了精兵强将，开始对武昌卫和长沙卫进行改造、训练。
这些人长期在火器卫所，对这些改造、训练早已了然于胸，轻车熟路。
武昌卫指挥使董天誉、长沙卫指挥使卫豪，也都是不可多得的将才。他们自然是全力配合。
无论是董天誉，还是卫豪，太子朱厚照还是非常放心的。
这两个人虽然不是太子朱厚照的嫡系，可是从他们日常的表现，以及掌握的情况来看，还是说得过去的。绝对称得上是忠心耿耿的优秀将领。
另外，太子朱厚照还让戊调查了一下董天誉和卫豪的嫡系。此二人出身也都是很好。平日里也没有什么不良嗜好。
这才让太子朱厚照彻底放心。
湖广军队整顿正是开始。
太子朱厚照先后部署了战后重建、粮食增产和军队整顿三件大事。
此时已经是九月末了。太子朱厚照已经出来很长时间了，他也打算回南京了。